РАЗРАБОТКА СПОСОБА ИНДИКАЦИИ И ИДЕНТИФИКАЦИИ VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS С ПОМОЩЬЮ REAL-TIME ПЦР

Article Sidebar

PDF (Русский)
Published: Nov 28, 2019

Main Article Content

Марина Владимировна Полеева
ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Ольга Сергеевна Чемисова
ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
Алексей Леонидович Трухачев
ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора
http://orcid.org/0000-0002-3531-1146

Abstract

Бактерии Vibrio parahaemolyticus могут быть причиной возникновения острого кишечного заболевания у людей, протекающего по типу пищевой токсикоинфекции. Успех лечебно-профилактических и санитарно-противоэпидемических мероприятий, направленных на предотвращение распространения «галофилезов», во многом зависит от своевременной точной идентификации штаммов вибрионов, выделяемых от больных, из морепродуктов и при мониторинге объектов окружающей среды. Представлена разработка способа идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом ПЦР в режиме «реального времени» (Real-Time PCR), который включает выделение хромосомной ДНК из исследуемого материала, постановку ПЦР со сконструированными нами праймерами, специфичными к участку гена коллагеназы vppC, и зондом, позволяющим детектировать амплифицированный фрагмент и проводить учет полученных результатов в режиме реального времени. Показана возможность индикации и идентификации микроорганизмов вида V. parahaemolyticus при исследовании проб биологического материала (рыба, морепродукты) на основе метода Real-Time PCR.

Article Details

How to Cite
Полеева, М. В., Чемисова, О. С., & Трухачев, А. Л. (2019). РАЗРАБОТКА СПОСОБА ИНДИКАЦИИ И ИДЕНТИФИКАЦИИ VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS С ПОМОЩЬЮ REAL-TIME ПЦР. Bulletin of Perm University. Biology, (2), 175–181. Retrieved from https://press.psu.ru/index.php/bio/article/view/2799
Issue
No. 2 (2019): Вестник Пермского университета. Серия Биология. №2. 2019
Section
Микробиология

License agreement

 

Author Biographies

Марина Владимировна Полеева, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора

Научный сотрудник

Ольга Сергеевна Чемисова, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора

Кандидат биологических наук, врио заместителя директора по научной работе

Алексей Леонидович Трухачев, ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора

Кандидат медицинских наук, заведующий лабораторией

References

Белькова Н.Л., Дзюба Е.В., Суханова Е.В. Молекулярно-генетическая идентификация кишечной микрофлоры и протистов байкальских рыб // Аннотированный список фауны оз. Байкал и его водосборного бассейна. Новосибирск: Наука, 2009. С. 957–980.

Белькова Н.Л. и др. Молекулярно-генетический мониторинг ассоциированной микрофлоры лососевидных рыб: разнообразие и физиологический статус // Известия Самарского научного центра РАН. 2010. Т. 12, № 1(4). С. 1108–1114.

Домницкий И.Ю. Ихтиопатология: краткий курс лекций. Саратов, 2016. 120 с.

Лабораторная диагностика заболеваний, вызываемых парагемолитическими и другими патоген-ными для человека вибрионами: МУК 4.2.1793-03. М.: Федеральный центр госсанэпиднадзора Минздрава России, 2004. 26 с.

Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микро-организмы I-IV групп патогенности: МУ 1.3.2569-09. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2010. 51 c.

Полеева М.В., Чемисова О.С. Использование масс-спектрометрического анализа для детекции бактериальных токсинов // ЖМЭИ. 2018. № 1. С. 93–101.

Ребриков Д.В. и др. ПЦР в реальном времени. М: Бином. Лаборатория знаний, 2019. 223 с.

Способ идентификации штаммов вида Vibrio paraharmolyticus методом ПЦР в режиме реально-го времени: пат. № 2016146441 Рос. Федера-ции, 2016. № 2644232; заявл. 08.02.2018. Бюл. № 4 / Чемисова О.С., Трухачев А.Л., Рыковская О.А., Полеева М.В.

Чемисова О.С. и др. Масс-спектрометрический анализ как метод идентификации и внутривидовой дифференциации Vibrio parahaemolyticus // Холера и патогенные для человека вибрио-ны: материалы проблемной комиссии. Ростов-н/Д, 2013. Вып. 26. С. 153–157.

Buller N.B. Bacteria from fish and other aquatic animals: a practical identification manual. Oxford-shire: CABI publishing, 2004. 361 p.

Chakraborty S., Nair G.B., Shinoda S. Pathogenic vibrios in the natural aquatic environment // Rev. Environ. Health. 1997. Vol. 12 (2). P. 63–80.

Daniels N.A.et al. Emergence of a new Vibrio para-haemolyticus serotype in raw oysters: A prevention quandary // J. Am. Med. Assoc. 2000. Vol. 284 (12). P. 1541–1545.

Deepanjali A. et al. Seasonal variation in abundance of total and pathogenic Vibrio parahaemolyticus bacteria in oysteralong the southwest coast of India // Appl. Environ. Microbiol. 2005. Vol. 71 (7). P. 3575–3580.

Di Pinto A., Ciccarese G., Tantillo G. A collagenase-targeted multiplex PCR assay for identification of Vibrio alginolyticus, Vibrio cholerae, and Vibrio parahaemolyticus // J. of Food Protection. 2005. Vol. 68, № 1. P. 150–153.

Hara-Kudo Y. et al. Improved method for detection of Vibrio parahaemolyticus in seafood // Appl. Envi-ron Microbiol. 2001. Vol. 67 (12). P. 5819–5823.

Li R. et al. A Novel PCR-Based Approach for Accu-rate Identification of Vibrio parahaemolyticus // Front Microbiol. 2016. Vol. 7. P. 44.

Luan X.-Y. et al. Comparison of different primers for rapid detection of Vibrio parahaemolyticus using the polymerase chain reaction // Lett. Appl. Micro-biol. 2007. Vol. 44 (3). P. 242–247.

Reham A.A., Amani M.S. Specific Detection of Patho-genic Vibrio species in shellfish by using multiplex polymerase chain reaction // J. Global Veterinaria. 2012. Vol. 8, № 5. P. 525–531.

Spanggaard B. et al. The microflora of rainbow trout intestine: a comparison of traditional and molecu-lar identification // Aquaculture. 2000. Vol. 182. P. 1–15.