ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ ПОЛОЖЕНИЕ ГАЛОТОЛЕРАНТНОГО ШТАММА BREVIBACTERIUM SP. U1, ВЫДЕЛЕННОГО ИЗ ЗАСОЛЕННОЙ ПОЧВЫ, В СИСТЕМЕ РОДА BREVIBACTERIUM

Article Sidebar

PDF (Русский)
Published: Dec 20, 2019

Main Article Content

Людмила Николаевна Ананьина
Институт экологии и генетики микроорганизмов УрO РАН – филиал ПФИЦ УрО РАН 614081, Пермь, ул. Голева, 13
http://orcid.org/0000-0003-4721-2863

Abstract

Исследовано филогенетическое положение галотолерантного штамма Brevibacterium sp. U1, выделенного ранее из почвы района промышленной соледобычи (г. Березники, Пермский край), в системе рода Brevibacterium на основе анализа нуклеотидных последовательностей ect-генов, кодирующих ферменты биосинтеза осмопротекторного вещества – этоина, и 16S рДНК. Анализ нуклеотидных последовательностей генов ectB и ectC согласовался с результатами анализа 16S рДНК. Однако было выявлено значительное эволюционное расстояние нуклеотидных последовательностей ectC-гена штамма Brevibacterium sp. U1 от филогенетически близкородственного вида B. aurantiacum.

Article Details

How to Cite
Ананьина, Л. Н. (2019). ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ ПОЛОЖЕНИЕ ГАЛОТОЛЕРАНТНОГО ШТАММА BREVIBACTERIUM SP. U1, ВЫДЕЛЕННОГО ИЗ ЗАСОЛЕННОЙ ПОЧВЫ, В СИСТЕМЕ РОДА BREVIBACTERIUM. Bulletin of Perm University. Biology, (4), 459–463. Retrieved from https://press.psu.ru/index.php/bio/article/view/2847
Issue
No. 4 (2019): Вестник Пермского университета. Серия Биология. №4. 2019
Section
Генетика

License agreement

 

Author Biography

Людмила Николаевна Ананьина, Институт экологии и генетики микроорганизмов УрO РАН – филиал ПФИЦ УрО РАН 614081, Пермь, ул. Голева, 13

кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии и биотехнологии

References

Ананьина Л.Н., Шестакова Е.А., Плотникова Е.Г. Детекция генов, кодирующих ферменты биосинтеза эктоина, у актинобактерий, выделен-ных из почвы района разработки Верхнекам-ского соленосного бассейна // Вестник Пермского университета. Сер. Биология. 2018. Вып. 3. С. 264–269.

Плотникова Е.Г. и др. Характеристика микроорганизмов, выделенных из техногенных почв Прикамья // Экология. 2006. № 4. С. 261-268.

Anan'ina L.N. et al. Naphthalenedegrading bacteria of the genus Rhodococcus from the Verkhnekamsk salt mining region of Russia // Antonie Van Leeuwenhoek. 2011. Vol. 100. P. 309-316.

Bernard T. et al. Ectoine accumulation and osmotic regulation in Brevibacterium linens // J. Gen. Microbiol. 1993. Vol. 139. P. 129-136.

Cai L. et al. Comparative genomics study of polyhydroxyalkanoates (PHA) and ectoine relevant genes from Halomonas sp. TD01 revealed extensive horizontal gene transfer events and coevolutionary relationships // Microb. Cell Fact. 2011. Vol. 1. P. 88.

Cogan T. M. et al. Biodiversity of the surface microbial consortia from Limburger, Reblochon, Livarot, Tilsit, and Gubbeen cheeses // Microbiol. Spectr. 2014. Vol. 2. doi: 10.1128/microbiolspec.CM-0010-2012.

Ivanova E.P. et al. Brevibacterium celere sp. nov., isolated from degraded thallus of a brown alga // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004. Vol. 54. P. 2107-2111.

Levesque S. et al. Mobilome of Brevibacterium aurantiacum sheds light on its genetic diversity and its adaptation to smearripened cheeses // Front. Mi-crobiol. 2019. Vol. 10. P. 1270.

Pham N.P. et al. Comparative genomic analysis of Brevibacterium strains: insights into key genetic determinants involved in adaptation to the cheese habitat // BMC Genomics. 2017. Vol. 7. P. 955.

Raymond R.L. Microbial oxidation of n-paraffinic hy-drocarbons // Develop. Ind. Microbiol. 1961. Vol. 2. P. 23-32.

Widderich N. et al. Biochemical properties of ectoine hydroxylases from extremophiles and their wider taxonomic distribution among microorganisms // PLoS One. 2014. Vol. 8. doi: 10.1371/journal.pone.0093809.

Wilson K. Preparation of genomic DNA from bacteria // Ausubel F.M., Brent R., Kingston R.E., Moore D.D., Seidman J.G., Smith J.A., Struhl K. (eds). Current protocols in molecular biology. 3rd edn. Wiley; New York, 1995.