ХАРАКТЕРИСТИКА БАКТЕРИЙ, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ РУДНИКА ВЕРХНЕКАМСКОГО МЕСТОРОЖДЕНИЯ СОЛЕЙ (ПЕРМСКИЙ КРАЙ)

Авторы

  • Анна Александровна Пьянкова «Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН» - филиал ПФИЦ УрО РАН
  • Дарья Игоревна Усанина ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет» http://orcid.org/0000-0003-0436-0890
  • Владислав Сергеевич Алеев ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет» http://orcid.org/0000-0002-2887-1268
  • Сергей Михайлович Блинов ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет» http://orcid.org/0000-0002-4953-3567
  • Елена Генриховна Плотникова «Институт экологии и генетики микроорга­низмов УрО РАН» - филиал ПФИЦ УрО РАН ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет» http://orcid.org/0000-0002-0107-0719

Ключевые слова:

Верхнекамское месторождение солей, галофильные и галотолерантные бактерии, гены 16S рРНК

Аннотация

Из глинистых отложений рассолоотводящих выработок и рассолосборников рудника Верхнекамского месторождения солей (Пермский край) было выделено 29 штаммов галофильных/галотолерантных бактерий. В результате филогенетического анализа, проведенного на основе сравнения последовательностей гена 16S рРНК, было установлено, что выделенные культуры являются представителями классов Gammaproteobacteria (семейств Halomonadaceae и Salinisphaeraceae) и Bacilli (семейства Bacillaceae). Три галофильных штамма SHV2, RV14 и SWV1 имели сходство с ближайшим типовым штаммом вида Salinisphaera hydrothermalis на уровне 95.94‒96.62% (ген 16S рРНК), что указывает на принадлежность этих штаммов к новому таксону. Большинство выделенных бактерий семейств Halomonadaceae и Bacillaceae являются экстремофилами: растут при рН 9‒10 и высокой солености среды (до 250‒270 г/л NaCl). У двух галофильных штаммов рода Halomonas обнаружена способность к деструкции салициловой и бензойной кислот (продуктов разложения полиароматических соединений), что делает их перспективными для использования в биотехнологиях восстановления загрязненных территорий с высоким уровнем минерализации.

Биографии авторов

Анна Александровна Пьянкова, «Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН» - филиал ПФИЦ УрО РАН

Инженер лаборатории молекулярной микробиологии и биотехнологии

Дарья Игоревна Усанина, ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»

Студент 

Владислав Сергеевич Алеев, ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»

Студент 

Сергей Михайлович Блинов, ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»

Кандидат геолого-минералогических наук, доцент кафедры динамической геологии и гидрогеологии 

Елена Генриховна Плотникова, «Институт экологии и генетики микроорга­низмов УрО РАН» - филиал ПФИЦ УрО РАН ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»

Доктор биологи­ческих наук, ведущий научный сотрудник лабо­ратории молекулярной микробиологии и биотехнологииПрофессор кафедры ботаники и генетики растений

Библиографические ссылки

Ананьина Л.Н. и др. Salinicola socius gen. nov., sp. nov. – умеренно галофильная бактерия из ассо-циации микроорганизмов, утилизирующей нафталин // Микробиология. 2007. Т. 76, № 3. С. 369‒376.

Егорова Д.О. и др. Особенности разложения хлорированных бифенилов штаммом Rhodococcus wratislaviensis KT112-7 в условиях засоления // Прикладная биохимия и микробиология. 2018. Т. 54, № 3. С. 253‒263.

Кандаурова Ю.М., Ястребова О.В., Плотникова Е.Г. Новый галотолерантный штамм-деструктор фталатов Halomonas sp. PG1 // История и методология физиолого-биохимических и почвенных исследований: материалы конф. Пермь, 2017. С. 71‒73.

Карташова Ю.А. и др. Изучение некультивируемых бактерий глубинной породы мергеля (Верхнекамское месторождение, Пермский край) // Биология – наука XXI века: материалы 21 междунар. Пущинской школы-конф. молодых ученых. Пущино, 2017. С. 23.

Кашапова Л.Э. и др. Молекулярно-генетические подходы к изучению микроорганизмов глубинной породы карналлита Верхнекамского месторождения солей // Высокие технологии, определяющие качество жизни: материалы междунар. науч. конф. Пермь, 2018. С. 52‒55.

Корсакова Е.С. Культивируемые аэробные бактерии из района промышленных разработок Верхнекамского месторождения солей: дис. … канд. биол. наук. Пермь, 2014. 150 с.

Корсакова Е.С. и др. Разнообразие бактерий семейства Halomonadaceae района разработок Верхнекамского месторождения солей // Мик-робиология. 2013. Т. 82, № 2. С. 247‒250.

Корсакова Е.С. и др. Микробное разнообразие в глинисто-солевых шламах калийного предприятия (г. Березники, Пермский край) // Вестник Пермского университета. Сер. Биология. 2017. Вып. 1. С. 70‒79.

Методы общей бактериологии: пер. с англ. М.: Мир, 1983. Т. 1‒3.

Практикум по агрохимии: учеб. пособие. М.: Изд-во МГУ, 2001. 689 с.

Пьянкова А.А., Ананьина Л Н. Оптимизация условий культивирования штамма Chromohalobacter sp. TC193 для увеличения биосинтеза эктоина // Материалы V международной конференции молодых ученых: биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов. Новоси-бирск, 2018. С. 97‒99.

Пьянкова А.А., Кашапова Л.Э., Плотникова Е.Г. Бактерии глубинной породы каменной соли (Верхнекамское месторождение солей) // Мате-риалы XI Всерос. конгресса молодых ученых-биологов с междунар. участием. Пермь, 2019. С. 65‒66.

Реутских Е.М., Саралов А.И. Exiguobacterium sp. RS34 – галоалкалотолерантная факультативно анаэробная неспорообразующая бактерия по-рядка Bacillales из шламохранилища калийного рудника // Вестник Пермского университета. Сер. Биология. 2012. Вып. 3. С. 49‒53.

Ястребова О.В., Пьянкова А.А., Плотникова Е.Г. Бактерии-деструкторы фталатов, выделенные из района промышленной добычи и переработ-ки калийно-магниевых солей // Прикладная биохимия и микробиология. 2019. Т. 55, № 4. С. 378‒385.

Ястребова О.В, Корсакова Е.С., Плотникова Е.Г. Характеристика бактерий семейства Micrococcaceae, выделенных из разных биотопов района солеразработок (Пермский край) // Известия Самарского научного центра РАН. 2018. Т. 20, №5(2). С. 300‒306.

Ai L., Huang Y., Wang C. Purification and characterization of halophilic lipase of Chromohalobacter sp. from ancient salt well // J. Basic. Microbiol. 2018. Vol. 58, № 8. P. 647‒657.

Anan'ina L.N. et al. Naphthalene-degrading bacteria of the genus Rhodococcus from the Verkhnekamsk salt mining region of Russia // Antonie van Leeuwenhoek. 2011. Vol. 100. P. 309‒316.

Edbeib M.F., Wahab R.A., Huyop F. Halophiles: biology, adaptation, and their role in decontamination of hypersaline environments // World J. Microbiol. Biotechnol. 2016. Vol. 32. P. 135.

Lane D.J. 16S/23S rRNA sequencing // Nucleic acid techniques in bacterial systematics / Eds Stacke-brandt E., Goodfellow M. New York.: John Wiley and Sons. 1991. P. 115‒175.

Megaw J., Gilmore B.F. Draft genome sequence of Halomonas sp. CSM-2, a moderately halophilic bacterium isolated from a triassic salt mine // Mi-crobiol. Resour. Announc. 2018. Vol. 26, № 7(3). P. e00836-18.

Nanca C.L. et al. Degradation of polycyclic aromatic hydrocarbons by moderately halophilic bacteria from Luzon alt Beds // J. Health Pollut. 2018. Vol. 8, № 19. P. 180915.

Plotnikova E.G. et al. Thalassospira permensis sp. nov., a novel halotolerant bacterium isolated from a naphthalene-utilizing microbial consortium // Microbiology. 2011. Vol. 80, № 5. Р. 703‒712.

Raymond R.L. Microbial oxidation of n-paraffinic hy-drocarbons // Develop. Ind. Microbiol. 1961. Vol. 2, № 1. P. 23‒32.

Romano I. et al. Oceanobacillus oncorhynchi subsp. incaldanensis subsp. nov., an alkalitolerant halophile isolated from an algal mat collected from a sulfurous spring in Campania (Italy), and emended description of Oceanobacillus oncorhynchi // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2006. Vol. 56. P. 805‒810.

Versalovic J. et al. Genomic fingerprinting of bacteria using repetitive sequence-based polymerase chain reaction // Meth. Cell Mol. Biol. 1994. Vol. 5. P. 25‒40.

Yastrebova O.V. et al. Aerobic spore forming bacteria from the region of salt mining // Russian Journal of Ecology. 2009. Vol. 40, № 7. P. 516‒521.

Загрузки

Опубликован

2020-12-23

Как цитировать

Пьянкова, А. А., Усанина, Д. И., Алеев, В. С., Блинов, С. М., & Плотникова, Е. Г. (2020). ХАРАКТЕРИСТИКА БАКТЕРИЙ, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ РУДНИКА ВЕРХНЕКАМСКОГО МЕСТОРОЖДЕНИЯ СОЛЕЙ (ПЕРМСКИЙ КРАЙ). Вестник Пермского университета. Серия «Биология»=Bulletin of Perm University. Biology, (4), 312–320. извлечено от https://press.psu.ru/index.php/bio/article/view/3973

Наиболее читаемые статьи этого автора (авторов)