Модели сегментации сердечных артерий по коронарографическим снимкам
DOI:
https://doi.org/10.17072/1993-0550-2025-2-65-87Ключевые слова:
сердечно-сосудистые заболевания, коронарография, сегментация коронарных сосудов, предобработка изображений, U-Net, механизмы внимания, глубокое обучениеАннотация
Сердечно-сосудистые заболевания продолжают лидировать среди причин смертности. Снизить смертность и повысить точность диагностики можно с помощью разработки решений на основе искусственного интеллекта. При этом важнейшей из задач является сегментация сердечных артерий. Точная сегментация коронарных сосудов на ангиографических снимках критически важна для выявления стеноза и планирования интервенционных процедур. Однако автоматизированные методы сегментации сталкиваются с рядом проблем, связанных с затруднением распознания сердечных артерий: неравномерное распределение контрастного вещества, артефакты движения, наложение теней от анатомических структур. В данной работе представлена модель сегментации сосудов на основе модифицированной архитектуры U-Net, включающей residual-блоки и механизмы внимания (SCSE) с предварительным обучением энкодера на искусственном датасете для выделения сосудистых признаков. Особое внимание уделено устойчивости модели к шумам – ключевой проблеме ангиографических данных, с которой не справляются многие существующие методы. Модель обучалась на смешанном наборе данных из 1285 двумерных коронарографических снимках, аннотированных экспертами. Предложенный подход достиг значения IoU 0.54 и F1-score 0.79 на тестовой выборке, демонстрируя устойчивость к шуму и артефактам. Дополнительная постобработка с адаптивной фильтрацией улучшила качество бинарных масок, устраняя ложные срабатывания от катетеров и металлических объектов. Внешняя оценка на 50 изображениях из независимого клинического набора показала IoU 0.50 и F1-score 0.75, что превосходит базовые методы сегментации, такие как классическая U-Net (IoU 0.42). Результаты подчеркивают эффективность предложенной модели для сегментации сосудов в условиях реальных ангиограмм, а также демонстрируют потенциал подхода как основы для последующей 3D-реконструкции сосудистой сети, что может улучшить диагностику и планирование лечения стеноза коронарных артерий.Библиографические ссылки
Roth G. A., Mensah G. A., Johnson C. O., Addolorato G., Ammirati E., Baddour L. M., Barasa A., Bikbov B., et al. Global burden of cardiovascular diseases and risk factors, 1990–2019 // Journal of the American College of Cardiology. 2020. Vol. 76. P. 2982–3021. DOI: 10.1016/j.jacc.2020.11.010.
World Health Organization. Global report on hypertension: the race against a silent killer. Geneva, Switzerland: WHO, 2024. URL:https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/376869/9789240094703-eng.pdf (дата обращения: 23.01.2025).
Libby P., Theroux P., Bonow R. O., Braunwald E., et al. Braunwald's Heart Disease: A Textbook of Cardiovascular Medicine. 11th ed. Philadelphia, PA: Elsevier, 2021.
Serruys P. W., Morice M. C., Kappetein A. P., et al. Percutaneous coronary intervention versus coronary-artery bypass grafting for severe coronary artery disease // New England Journal of Medicine. 2009. Vol. 360. P. 961–972. DOI: 10.1056/NEJMoa0804626.
Scanlon P. J., Faxon D. P., Audet A. M., et al. ACC/AHA guidelines for coronary angiography // Journal of the American College of Cardiology. 1999. Vol. 33. P. 1756–1824. DOI:10.1016/S0735-1097(99)00126-6.
Sarwal A., Dhawan A. P. Three dimensional reconstruction of coronary arteries from two views // Computers in Biology and Medicine. 1993. Vol. 23, No. 1. P. 25–39. DOI: 10.1016/S0169-2607(00)00116-4.
Ravandi B., Ravandi A. Network-based approach for modeling and analyzing coronary angiography // Complex Networks XI: Proceedings of the 11th Conference on Complex Networks CompleNet 2020. Springer, 2020. DOI: 10.1007/978-3-030-40943-2_15.
Shen D., Wu G., Suk H. I. Deep learning in medical image analysis // Annual Review of Biomedical Engineering. 2017. Vol. 19. P. 221–248. DOI: 10.1146/annurev-bioeng-071516-044442.
Avram R., Olgin J. E., Tison G. H., et al. CathAI: fully automated coronary angiography interpretation and stenosis estimation // NPJ Digital Medicine. 2023. Vol. 6. Article number: 147. DOI: 10.1038/s41746-023-00880-1.
Ronneberger O., Fischer P., Brox T. U-Net: convolutional networks for biomedical image segmentation // arXiv preprint arXiv:1505.04597. 2015. DOI: 10.48550/arXiv.1505.04597 (дата обращения: 15.03.2025).
He K., Zhang X., Ren S., Sun J. Deep residual learning for image recognition // Proceedings of the IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR). 2016. P. 770–778. DOI: 10.1109/CVPR.2016.90.
Guha Roy A., Navab N., Wachinger C. Concurrent spatial and channel squeeze & excitation in fully convolutional networks // arXiv preprint arXiv:1803.02579. 2018. DOI:10.48550/arXiv.1803.02579 (дата обращения: 13.03.2025).
Label Studio. Label Studio: open source data labeling platform. 2023. URL: https://labelstud.io (дата обращения: 10.02.2025).
Zhou Z., Shin J., Zhang L., et al. Models Genesis: generic autodidactic models for 3D medical image analysis // In: MICCAI. 2019. P. 3–13. DOI: 10.1007/978-3-030-32251-9_42.
Comaniciu D., Meer P. Mean shift: a robust approach toward feature space analysis // IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 2002. Vol. 24, No. 5. P. 603–619. DOI: 10.1109/34.1000236.
Canny J. A computational approach to edge detection // IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 1986. Vol. 8, No. 6. P. 679–698. DOI: 10.1109/TPAMI.1986.4767851.
Sobel I. An isotropic 3× 3 image gradient operator. Presentation at Stanford Artificial Intelligence Project (SAIL). 1968.
Gonzalez R.C., Woods R.E. Digital Image Processing. 4th ed. London: Pearson, 2018.
Zhou Z., Siddiquee M. M. R., Tajbakhsh N., Liang J. UNet++: a nested U-Net architecture for medical image segmentation // arXiv preprint arXiv:1807.10165. 2018. DOI: 10.1007/978-3-030-00889-5_1.
Chen L.C., Zhu Y., Papandreou G., Schroff F., Adam H. Encoder-decoder with atrous separable convolution for semantic image segmentation // Proceedings of the European Conference on Computer Vision (ECCV), Munich, Germany, 8–14 September 2018. P. 801–818. DOI: 10.48550/arXiv.1802.02611 (дата обращения: 21.03.2025).
Yu F., Koltun V. Multi-scale context aggregation by dilated convolutions // arXiv preprint arXiv:1511.07122. 2015.DOI: 0.48550/arXiv.1511.07122 (дата обращения: 25.03.2025).
Isensee F., Jaeger P.F., Kohl S. A.A., et al. nnU-Net: a self-configuring method for deep learning-based biomedical image segmentation // Nature Methods. 2021. Vol. 18. P. 203–211. DOI: 10.1038/s41592-020-01008-z.
Loshchilov I., Hutter F. Decoupled weight decay regularization // arXiv preprint arXiv:1711.05101. 2017. DOI: 10.48550/arXiv.1711.05101 (дата обращения: 29.03.2025).
Savitzky A., Golay M. J. E. Smoothing and differentiation of data by simplified least squares procedures // Analytical Chemistry. 1964. Vol. 36, No. 8. P. 1627–1639. DOI: 10.1021/ac60214a047.
Rezatofighi H., Tsoi N., Gwak J., et al. Generalized intersection over union: a metric and a loss for bounding box regression // arXiv preprint arXiv:1902.09630. 2019. DOI: 10.1109/CVPR.2019.00075.
Zeng Y., Liu H., Hu J., Zhao Z., She Q. Pretrained subtraction and segmentation model for coronary angiograms // Scientific Reports. 2024. Vol. 14. Article number: 71063. DOI: 10.1038/s41598-024-71063-5.
Litjens G., Kooi T., Bejnordi B. E., Setio A. A. A., Ciompi F., Ghafoorian M., van der Laak J. A. W. M., van Ginneken B., Sánchez C. I. A survey on deep learning in medical image analysis // Medical Image Analysis. 2017. Vol. 42. P. 60–88. DOI: 10.1016/j.media.2017.07.005.
Oktay O., Schlemper J., Folgoc L. L., Lee M., Heinrich M., Misawa K., Mori K., McDonagh S., Hammerla N. Y., Kainz B., Glocker B., Rueckert D. Attention U-Net: learning where to look for the pancreas // arXiv preprint arXiv:1804.03999. 2018. DOI:10.48550/arXiv.1804.03999 (дата обращения: 05.04.2025).
Çiçek Ö., Abdulkadir A., Lienkamp S.S., Brox T., Ronneberger O. 3D U-Net: learning dense volumetric segmentation from sparse annotation // In: Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI). 2016. P. 424–432. DOI: 10.1007/978-3-319-46723-8_49.
Загрузки
Опубликован
Как цитировать
Выпуск
Раздел
Лицензия
Copyright (c) 2025 Владислав Антонович Бочкарев, Александр Андреевич Усынин, Александр Денисович Осипов, Михаил Русланович Аухадиев, Роман Владиславович Шаров, Марина Александровна Барулина

Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution» («Атрибуция») 4.0 Всемирная.
Публикация статьи в журнале осуществляется на условиях лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0).
