МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИДЕНТИФИКАЦИЯ ПОПУЛЯЦИЙ PINUS SYLVESTRYS L. НА ВОСТОКЕ РУССКОЙ РАВНИНЫ НА ОСНОВАНИИ ПОЛИМОРФИЗМА ISSR-МАРКЕРОВ

Авторы

  • Яна/Yana Викторовна/Viktorovna Пришнивская/Prishnivskaya ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»; Естественнонаучный институт ПГНИУ
  • Виталий/Vitaliy Павлович/Pavlovich Красильников/Krasilnikov ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»
  • Светлана/Svetlana Витальевна/Vitalievna Боронникова/Boronnikova ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»

Ключевые слова:

полиморфизм днк, issr-маркеры, молекулярно-генетическая идентификация

Аннотация

Проведены молекулярно-генетический анализ и идентификация четырех популяций Pinus sylvestis L., расположенных в Республике Коми и в Кировской обл., с использованием ISSR-метода анализа полиморфизма ДНК. У четырех изученных популяций P. sylvestris выявлены 117 ISSR-маркеров; установлена высокая доля полиморфных локусов (Р95 =0.949). Один ISSR-праймер инициировал у P. sylvestris синтез в среднем 16.7 ISSR-маркеров. В изученных популяциях выявлено 16 редких ISSR-маркеров. Выявлены идентификационные мономорфные видовые и полиморфные ISSR-маркеры, а также их сочетания для молекулярно-генетической идентификации изученных популяций. Составлены молекулярно-генетические формулы и штрихкоды четырех изученных популяций. Полученные данные могут быть использованы для идентификации популяций и древесины P. sylvestris в изученных регионах.

Биографии авторов

Яна/Yana Викторовна/Viktorovna Пришнивская/Prishnivskaya, ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»; Естественнонаучный институт ПГНИУ

Аспирант кафедры ботаники и генетики растений;Инженер-исследователь лаборатории молекулярной биологии и генетики

Виталий/Vitaliy Павлович/Pavlovich Красильников/Krasilnikov, ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»

Магистрант биологического факультета

Светлана/Svetlana Витальевна/Vitalievna Боронникова/Boronnikova, ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»

Доктор биологических наук, профессор, зав. кафедрой ботаники и генетики растений

Библиографические ссылки

Боронникова C.B. Исследование генетической изменчивости популяций редкого вида Урала Adenophora lilifolia (L.) DC. на основании анализа полиморфизма ISSR-маркеров // Генетика. 2009. Т. 45, № 5. С. 652-655.

Боронникова C.B. Молекулярно-генетический анализ и оценка состояния генофондов ресурсных видов растений Пермского края: монография. Пермь, 2013. 223 с.

Боронникова C.B., Календарь Р.И. Использование IRAP-метода для анализа генетической изменчивости популяций ресурсных и редких видов растений // Генетика. 2010. Т. 46, № 1 С. 44-50.

Ветчинникова Л.В., Титов А. Ф., Кузнецова Т.Ю. Карельская береза: биологические особенности, динамика ресурсов и воспроизводство. Петрозаводск: Карельский научный центр РАН, 2013. 312 с.

Грант В. Видообразование у растений. М.: Мир, 1984. 528 с.

Исаев A.C., Коровин Г.И. Актуальные проблемы национальной лесной политики / Центр по проблемам экологии и продуктивности лесов Российской академии наук. М., 2009. 108 с.

Левонтин P.C. Генетические основы эволюции. М.: Мир, 1978. 351 с.

Материалы к заседанию "круглого стола" на тему «Законодательное обеспечение основных направлений развития лесного хозяйства на базе инновационных научно-технических достижений». 2012. URL: http://council.gov.ru/media/files/41d4935c0f740f5 ela2b.pdf (дата обращения: 03.04.2016).

Нечаева Ю.С. Оптимизация методики выделения ДНК некоторых хвойных видов растений Пермского края // Материалы международной конференции «Синтез знаний в естественных науках. Рудник будущего: проекты, технологии, оборудование». Пермь, 2011. С. 278-282.

Основные результаты работы Министерства природных ресурсов и экологии Российской Федерации за 2013 г. URL: http://government.ru/dep_news/11859/ (дата обращения: 02.04.2016).

Geburek Т., Turok J. Conservation and sustainable management of forest genetic resources in Europe - an introduction // Conservation and Management of Forest Genetic Resources in Europe. Ar-bora Publishers, Zvolen, 2005. P. 3-8.

Rogers S.O., Bendich A.J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues // Plant Molecular Biology. 1985. Vol. 1, № 19. P. 69-76.

Zietkiewicz E. Rafalski A., Labuda D. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification // Genomics. 1994. Vol. 20. P. 176-183.

References

Boronnikova S.V. Molekuljarno-genetuceskij analiz i ocenka sostojanija genofondov resursnych vidov rastenij Permskogo kraja [Molecular genetic analysis and assessment of gene pools of resource species of plants of Perm region: monograph], Perm, 2013. 223 p. (In Russ.).

Boronnikova S.V. Genetic variation in Ural populations of the rare plant species Adenophora lilifolia (L.) D. on the basis of analysis of polymorphism of ISSR-markers. Russian Journal of Genetics. 2009, V. 45, N5, pp. 571-574.

Boronnikova S.V., Kalendar R.N. Using IRAP-markers for analisis of genetic variability in populations of resource and rare species of plants. Russian Jornal of Genetics. 2010, N 1 (46), pp. 36-42.

Geburek Т., Turok J. Conservation and sustainable management of forest genetic resources in Europe - an introduction. Conservation and Management of Forest Genetic Resources in Europe. Arbora Publishers, Zvolen, 2005, pp. 3-8.

Grant B. Vidoobrazovanie и rastenij [Speciation in plants], Moscow, Mir Publ., 1984. 528 p. (In Russ.).

Isaev A.S., Korovin G.N. Aktual'nye problemy national 'noj lesnoj politiki [Actual problems of the National Forest Policy]. Moscow, 2009. 108 p. (In Russ.).

LewontinR.S. Geneticeskie osnovy Svoljucii [Genetic bases of the evolution], Moscow, Mir Publ., 1978. 351 p. (In Russ.).

Materials for the meeting of the "round table" on "Legislative support of the main directions of forestry development based on innovative scientific and technological achievements." 2012. URL: http://council.gov.ru/media/files/41d4935c0f740f5ela2b.pdf (reference date 03/04/2016). (In Russ.).

Nechaeva Yu.S. [Optimization of DNA extraction methods of some coniferous species of plants of Perm region], Materialy mezdunarodnoj konfer-encii "Sintez znanij v estestvennych naukach. Rudnik buduscego: proekty, technologii, oborudo-vanie" [Proceedings of the international conference «Knowledge Synthesis in the natural sciences. Rudnik future: projects, technologies and equipment»]. Perm, 2011, pp. 278- 282. (In Russ.).

Rogers S.O., Bendich A.J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues. Plant Molecular Biology, 1985, V. 1, N 19, pp. 69-76.

The main results of the Ministry of Natural Resources and Ecology of the Russian Federation in 2013. URL: http://government.ru/dep_news/11859/ (reference date 02/04/2016). (In Russ.).

Vetchinnikova L.V., Titov A.F., Kuznetsova T.Y. Karel'skaja bereza: biologiceskie osobennosti, dinamika resursov i vosproizvodstvo [Karelian birch: biological features, dynamics and reproduction of resources]. Petrozavodsk, Karelian Research Centre of Russian Academy of Science, 2013. 312 p. (In Russ.).

Zietkiewicz E. Rafalski A., Labuda D. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR) -anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics, 1994, V. 20, pp. 176-183.

Загрузки

Опубликован

2018-10-23

Как цитировать

Пришнивская/Prishnivskaya Я. В., Красильников/Krasilnikov В. П., & Боронникова/Boronnikova С. В. (2018). МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИДЕНТИФИКАЦИЯ ПОПУЛЯЦИЙ PINUS SYLVESTRYS L. НА ВОСТОКЕ РУССКОЙ РАВНИНЫ НА ОСНОВАНИИ ПОЛИМОРФИЗМА ISSR-МАРКЕРОВ. Вестник Пермского университета. Серия «Биология»=Bulletin of Perm University. Biology, (2), 171–176. извлечено от http://press.psu.ru/index.php/bio/article/view/1805