@article{Брацун (Dmitry Bratsun)_Лоргов (Evgenii Lorgov)_Полуянов (Alexander Poluyanov)_2018, title={Об устойчивости репрессилятора с запаздывающей экспрессией генов}, url={https://press.psu.ru/index.php/phys/article/view/1385}, DOI={10.17072/1994-3598-2018-2-75-87}, abstractNote={<a name="OLE_LINK18"></a><span>Репрессилятором называют первую в синтетической биологии генную регуляторную сеть, искусственно сконструированную в Гарвардском университете в 2000 году. Он представляет собой замкнутую сеть из трех генетических </span><a name="OLE_LINK52"></a><a name="OLE_LINK51"></a><span>элементов </span><em><span lang="EN-US">lacI</span></em><span>, λ</span><em><span lang="EN-US">cI</span></em><span>и </span><em><span lang="EN-US">tetR</span></em><span>, ко</span><span>торые имеют естественное происхождение, но в такой комбинации в природе не встречаются. Промотор каждого из трёх генов контролирует следующий за ним цистрон по принципу отрицательной обратной связи, подавляя <a name="OLE_LINK4"></a><a name="OLE_LINK3"></a>экспрессию соседнего гена. В данной работе впервые рассматривается нелинейная динамика репрессилятора, у которого имеются запаздывания по времени во всех звеньях регуляторной цепи. Запаздывание может быть как естественным, т.е. возникать во время транскрипции/трансляции генов в силу многоступенчатого характера этих процессов, так и искусственным, т.е. специально вноситься в работу регуляторной сети с помощью методов синтетической биологии. Предполагается, что регуляция осуществляется протеинами в димерной форме. В работе в рамках детерминистского описания методом разложения на быстрые и медленные движения получена система нелинейных дифференциальных уравнений с запаздыванием на медленном многообразии. Показано, что при определенных значениях управляющих параметров единственное состояние равновесия теряет устойчивость колебательным образом. Для симметричного репрессилятора, у которого все три гена идентичны, получено аналитическое решение для нейтральной кривой бифуркации Андронова-Хопфа. Для общего случая асимметричного репрессилятора нейтральные кривые построены численно. </span><span>Обсуждается место предложенной в работе модели среди других теоретических моделей репрессилятора.</span>}, number={2(40)}, journal={Вестник Пермского университета. Физика}, author={Брацун (Dmitry Bratsun) Дмитрий Анатольевич and Лоргов (Evgenii Lorgov) Евгений Сергеевич and Полуянов (Alexander Poluyanov) Александр Олегович}, year={2018}, month={июл.} }