TY - JOUR AU - Недашковский, Игорь Сергеевич AU - Сермягин, Александр Александрович AU - Костюнина, Ольга Васильевна AU - Волкова, Валерия Владимировна AU - Гладырь, Елена Александровна AU - Янчуков, Иван Николаевич PY - 2021/12/24 Y2 - 2024/03/28 TI - Популяционно-генетическая характеристика, оценка геномного инбридинга и гомозиготности крупного рогатого скота черно-пестрой и голштинской пород по STR и SNP маркерам в России JF - Вестник Пермского университета. Серия Биология JA - Вестник ПГУ Биология VL - IS - 4 SE - Генетика DO - 10.17072/1994-9952-2021-4-295-306 UR - https://press.psu.ru/index.php/bio/article/view/5080 SP - 295-306 AB - <p>Объект исследования – быки-производители черно-пестрой и голштинской пород, имеющие <em>STR</em> профили и прошедшие процедуру генотипирования по <em>SNP</em>-маркерам. Предмет исследования – уровень геномного инбридинга и гомозиготности, а также популяционно-генетическая характеристика на их основе. С возрастанием <em>Fx</em>, основанного на данных родословного учета, отмечено увеличение уровня геномного инбридинга (<em>F<sub>ROH</sub></em>), рассчитанного по <em>SNP</em>-маркерам. Результаты по 9 <em>STR</em>-маркерам фиксируют волнообразное увеличение гомозиготности от I до IV группы с последующим возрастанием, начиная с V и до VII группы включительно. В ходе исследования средних значений <em>F<sub>ROH</sub></em> в соответствии с годами рождения быков было установлено достоверное отличие двух последних групп (2009–2011 и 2012–2014 гг.) от всех остальных при попарном сравнении. Результаты расчета <em>F<sub>ROH</sub></em> и <em>Ca9</em> быков из разных стран происхождения указывают на статистически значимую дифференциацию. Отмечено достоверное отличие наибольшего по выборкам уровня <em>F<sub>ROH</sub></em> в голштинской черно-пестрой породе от красно-пестрой голштинской и черно-пестрой пород. Значения <em>Fst</em> между породной принадлежностью животных по <em>SNP</em> и <em>STR </em>имели незначительную дифференциацию (0.008–0.027). Различия в расчете по <em>STR</em> между черно-пестрой голштинской и красно-пестрой голштинской породами оказались незначительны (менее 20%), в то время как остальные величины разнились многократно. <em>Fst</em> между животными РФ и Германии, РФ и Нидерланд по данным <em>STR</em> равен 0.006 и 0.008, по данным <em>SNP</em> 0.005 и 0.006, соответственно. Отмечено взаимное увеличение значения <em>Fst </em>и года рождения быка-производителя, что подчеркивает наибольшую удаленность популяции 1983–1997 гг. от популяций последних лет. Схожесть значений <em>Fst</em> между генеалогическими линиями сменяется значительным разбросом в показателях при попарном их сравнении.</p> ER -