ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ БАКТЕРИЙ СЕМЕЙСТВА MICROCOCCACEAE, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ БИОТОПОВ С РАЗЛИЧНЫМ АНТРОПОГЕННЫМ ВОЗДЕЙСТВИЕМ

Ольга Викторовна Ястребова, Елена Генриховна Плотникова

Аннотация


Проанализированы данные по систематической принадлежности и распространению бактерий сем. Micrococcaceae, выделенных из экосистем с различной степенью антропогенной нагрузки (г. Пермь, Березники, Соликамск, Оса; Пермский край). Показано филогенетическое разнообразие и широкое распространение представителей семейства Micrococcaceae в различных биотопах района разработок Верхнекамского месторождения солей. Разнообразие видов бактерий семейства Micrococcaceae выявлено в почве и ризосфере растений, произрастающих вблизи солеотвалов. На основании анализа гена 16S рРНК исследуемые штаммы семейства Micrococcaceae были отнесены к семи родам: Arthrobacter, Pseudoarthrobacter, Glutamicibacter, Micrococcus, Kocuria, Nesterenkonia, Rothia. Исследуемые культивируемые бактерии семейства Micrococcaceae, выделенные из экотопов с экстремальными условиями среды, являются перспективными для дальнейшего их использования в биотехнологических целях.

Ключевые слова


Micrococcaceae; идентификация; ген 16S рРНК; засоление; загрязненные экотопы

Полный текст:

PDF

Литература


Гагарских О.Н., Корсакова Е.С. Галотолерантные бактерии рода Arthrobacter, выделенные из загрязненных почв и отходов соледобывающих предприятий Пермского края // Симбиоз-Россия 2014: материалы VII Всероссийского Конгресса молодых биологов. Екатеринбург, 2014. С. 105‒107.

Гагарских О.Н., Ястребова О.В. Характеристика галотолерантого штамма-деструктора фталатов Arthrobacter sp. PD13-12 // Симбиоз – 2017: X Всерос. конгресс молодых ученых-биологов: сб. тез. Казань, 2017. C. 75–76.

Корсакова Е.С., Пьянкова А.А., Плотникова Е.Г. Бактерии-деструкторы стойких органических загрязнителей – эфиров фталевой кислоты, как основа для создания новых экобиотехнологий // Известия Самарского научного центра РАН. 2013. Т. 15, № 3 (5). С. 1633‒1636.

Плотникова Е.Г. и др. Галотолерантные бактерии рода Arthrobacter – деструкторы полицикличе-ских ароматических углеводородов // Экология. 2011. № 6. С. 459–466.

Юдин Д.С., Ястребова О.В., Плотникова Е.Г. Характеристика бактерий рода Koсuria – актив-ных деструкторов фталатов // VI Международ-ная конференция молодых ученых: биофизи-ков, биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов: сб. тез. Новосибирск, 2019. С. 236‒239.

Ястребова О.В., Юдин Д.С., Плотникова Е.Г. Выделение и характеристика смешанных культур и бактерий-деструкторов фталатов // Утилизация и рециклинг отходов производства и потребления: инновационные подходы и технологии: I Всерос. науч.-практ. конф. Киров, 2019. С. 160‒162.

Altenburger P. et al. Citricoccus muralis gen. nov., sp. nov., a novel actinobacterium isolated from a me-dieval wall painting // International Journal of Sys-tematic and Evolutionary Microbiology. 2002. Vol. 52. P. 2095–2100.

Bergan T., Kocur M. Stomatococcus mucilaginosus gen. nov., sp. nov., ep. rev., a member of the family Micrococcaceae // International journal of systematic bacteriology. 1982. Vol. 32. P. 374–377.

Busse H.J. Review of the taxonomy of the genus Arthrobacter, emendation of the genus Arthrobacter sensulato, proposal to reclassify selected species of the genus Arthrobacter in the novel genera Glutamicibacter gen. nov., Paeniglutamicibacter gen. nov., Pseudoglutamici-bacter gen. nov., Paenarthrobacter gen. nov. and Pseudarthrobacter gen. nov., and emended description of Arthrobacter roseus // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2016. Vol. 66. P. 9–37.

Cao Y.R. et al. Enteractinococcus coprophilus gen. nov., sp. nov., of the family Micrococcaceae, isolated from Panthera tigris amoyensis faeces, and transfer of aniella fodinae Dhanjal et al. 2011 to the genus Enteractinococcus as Enteractinococcus fodinae comb. nov. // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2012. Vol. 62. P. 2710–2716.

Cohn F. Untersuchungen über Bakterien // Beiträge zur Biologie der Pflanzen.1872. Vol. 1 (Heft II). P. 127–224.

Conn H.J., Dimmick I. Soil bacteria similar in morphology to Mycobacterium and Corynebacterium // Journal of Bacteriology. 1947. Vol. 54. P. 291–303.

Hamedi J., Mohammadipanah F., Ventosa A. Syste-matic and biotechnological aspects of halophilic and halotolerant actinomycetes // Extremophiles. 2013. Vol. 17. P. 1‒13.

Hu J., Yang Q., Wang J.L. Biodegradation of din-butyl phthalate in sequencing batch reactor bioaugmented with Micrococcus sp. and the bacterial community analysis // International Journal of Environmental Science and Technology. 2015. Vol. 12. P. 2819–2828.

Georg L.K., Brown J.M. Rothia, gen. nov. an anaerobic genus of the family Actinomycetaceae // International journal of systematic bacteriology. 1967. Vol. 17. P. 79–88.

Koch C., Schumann P., Stackebrandt E. Reclassification of Micrococcus agilis (Ali-Cohen 1889) to the genus Arthrobacter as Arthrobacter agilis comb. nov., and emendation of the genus Arthrobacter // International journal of systematic bacteriology. 1995. Vol. 45. P. 837–839.

Kumar S. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets // Molecu-lar Biology and Evolution. 2016. Vol. 33. P. 1870‒1874.

Kushner D. Life in high salt and solute concentrations // Microbial life in extreme environments. 1978. P. 317–368.

Li W.J., Zhi X.Y., Euzéby J.P. Proposal of Yaniellaceae fam. nov., Yaniella gen. nov. and Sinobaca gen. nov. as replacements for the illegitimate pro-karyotic names Yaniaceae //. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2008. Vol. 58. P. 525–527.

Pribram E. A contribution to the classification of microorganisms // Journal of Bacteriology. 1929. Vol. 18. P. 361–394.

Pukall R. et al. Acaricomes phytoseiuli gen. nov., sp. nov., isolated from the predatory mite Phytoseiulus persimilis // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2006. Vol. 56. P. 465–469.

Raymond R.L. Microbial oxidation of n-paraffinic hydrocarbons // Developments in Industrial Microbi-ology. 1961. Vol. 2, № 1. P. 23‒32.

Sanders J.E., Fryer J.L. Renibacterium salmoninarum gen. nov., sp. nov., the causative agent of bacterial kidney disease in salmonid fishes // International journal of systematic bacteriology. 1980. Vol. 30. P. 496–502.

Stackebrandt E. et al. Taxonomic dissection of the ge-nus Micrococcus: Kocuria gen. nov., Nesterenko-nia gen. nov., Kytococcus gen. nov., Dermacoccus gen. nov., and Micrococcus Cohn 1872 gen. emend. // International journal of systematic bacteriology. 1995. Vol. 45. P. 682–692.

Stackebrandt E., Rainey F.A., Ward-Rainey N.L. Proposal for a new hierarchic classification system, Actinobacteria classis nov. // International journal of systematic bacteriology. 1997. Vol. 47. P. 479–491.

Vandera E. et al. Comparative proteomic analysis of Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 on phe-nanthrene, phthalate and glucose // Journal of Pro-teomics. 2015. Vol. 113. P. 73‒89.

Weisburg W.G. et al. 16S ribosomal DNA amplifica-tion for phylogenetic study // Journal of Bacteriol-ogy. 1991. Vol. 173. P. 697–703.

Yassin A.F. et al. Auritidibacter ignavus gen. nov., sp. nov., a novel bacterium of the family Micrococcaceae isolated from ear swab of a man with otitis externa, transfer of the family Yaniellaceae Li et al. 2008 to the family Micrococcaceae and emended description of the suborder Micrococcineae // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2011. Vol. 61. P. 223–230.

Zhang Y.Q. et al. Zhihengliuella halotolerans gen. nov., sp. nov., a novel member of the family Micrococcaceae // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2007. Vol. 57. P. 1018–1023.

Zhou Y. et al. Proposal of Sinomonas flava gen. nov., sp. nov., and description of Sinomonas atrocyanea comb. nov. to accommodate Arthrobacter atrocyaneus // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2009. Vol. 59. P. 259–263.


Ссылки

  • На текущий момент ссылки отсутствуют.


(c) 2020 Ольга Викторовна Ястребова, Елена Генриховна Плотникова

ISSN 1994-9952

Адрес учредителя и издателя:614990, г. Пермь, ул. Букирева, 15; ПГНИУ

Адрес редакции:614990, г. Пермь, ул. Букирева, 15; ПГНИУ, биофак

E-mail:  vestnik_psu_bio@mail.ru

Подписной индекс в каталоге ОАО «Пресса России. Том 1. Газеты и журналы»: 41000





Вестник Пермского университета. Биология=Bulletin of Perm University. Biology на elibrary