СКРИНИНГ ГЕНА АЛЬФА-СУБЪЕДИНИЦЫ БЕНЗОАТ ДИОКСИГЕНАЗЫ В БАКТЕРИАЛЬНЫХ АССОЦИАЦИЯХ, ПОЛУЧЕННЫХ В РЕЗУЛЬТАТЕ СЕЛЕКЦИИ НА (ХЛОР)АРОМАТИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЯХ

Дарья Олеговна Егорова, Анна Александровна Пьянкова

Аннотация


Показано, что в тотальной ДНК шести бактериальных ассоциаций, полученных в результате накопительного культивирования в присутствии бифенила/хлорированных бифенилов, обнаружены фрагменты гена benA, кодирующего альфа-субъединицу бензоат диоксигеназы. В результате филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей амплифицированных фрагментов гена benA установлено, что большинство изученных фрагментов формируют кластеры с гомологичными генами представителей отдела/филума Proteobacteria, уровень сходства при этом составил 100%. Уровень сходства с benA-генами известных грамотрицательных штаммов-деструкторов составил 79.5–89.7%. В ассоциации CHN4 выявлен ген benA, формирующий единый кластер с геном benA штаммов рода Rhodococcus, и на 96% схожий с гомологичным геном штамма-деструктора R. jostii RHA1.

Ключевые слова


полихлорированные бифенилы; бактериальные ассоциации; бензоат диоксигеназа; ген

Полный текст:

PDF

Литература


Назарова Э.А., Кирьянова Т.Д., Егорова Д.О. Разнообразие гена бензоат диоксигеназы в бактериальных ассоциациях, сформировавшихся под давлением хлорорганического загрязнения // Экологическая генетика. 2019. Т. 17, № 3. С. 13–22. doi: 10.17816/ecogen17313-22

Abd El-Mawla A.M., Beerhues L. Benzoic acid biosynthesis in cell cultures of Hypericum androsaemum // Planta. 2002. Vol. 214. P.727. https://doi.org/10.1007/s004250100657

Baggi G. et al. Co-metabolism of di- and trichlorobenzoates in a 2-chlorobenzoate-degrading bacterial culture: Effect of the position and number of halosubstituents // International Biodeterioration and Biodegradation. 2008. Vol. 62, № 1. P. 57–64.

doi:10.1016/j.ibiod.2007.12.002

Field J.A., Sierra-Alvarez R. Microbial transformation of chlorinated benzoates // Reviews in Environmental Science and BioTechnology. 2008a. Vol. 7. P. 191–210. doi 10.1007/s11157-008-9133-z

Field J.A., Sierra-Alvarez R. Microbial transformation and degradation of polychlorinated biphenyls // Environmental Pollution. 2008b. Vol. 155, № 1. P. 1–12.

Haddad S., Eby D.M., Neidle E.L. Cloning and ex-pression of the benzoate dioxygenase genes from Rhodococcus sp. strain 19070. // Applied Envi-ronmental Microbiology. 2001. Vol. 67. P. 2507–2514.

Kahlon R.S. Pseudomonas: Molekular and Applied Biology. Springer International Publishing Swit-zerland, 2016. 519 p. doi: 10.1007/978-3-319-31198-2_4

Kimura N. et al. Pseudomonas furukawaii sp. nov., a polychlorinated biphenyl-degrading bacterium isolated from biphenyl-contaminated soil in Japan // International Journal Systematic Evolution Micro-biology. 2018. Vol. 68, № 5. P. 1429–1435.

Kitagawa W. et al. Cloning and characterization of benzoate catabolic genes in the gram-positive polychlorinated biphenyl degrader Rhodococcus sp. strain RHA1 // Journal of Bacteriology. 2001. Vol. 183. P. 6598–6606.

Parales R.E., Resnick S.M. Aromatic Ring Hydroxylating Dioxygenases // Pseudomonas / J.L. Ramos, R.C. Levesque, eds. Boston: Springer, 2006. P. 287–340. doi:10.1007/2F0-387-28881-3_9

Pieper D.H. Aerobic degradation of polychlorinated biphenyls. // Applied Microbiology Biotechnology. 2005. Vol. 67, № 2. P. 170–191. https://doi.org/10.1007/s00253-004-1810-4

Solyanikova I.P. et al. Pecularities of the degradation of benzoate and its chloro- and hydraxy-substituted analogs by Actinobacteria. // International Biodeterioration and Biodegradation. 2015. Vol. 100. P. 155–164. doi: 10.1016/j.ibiod.2015.02.028

Suenaga H. et al. Insights into the genomic plasticity of Pseudomonas putida KF715, a strain with unique biphenyl-utilizing activity and genome instability properties // Environmenmental Microbi-ology Reports. 2017. Vol. 9, № 5. P. 589–598.


Ссылки

  • На текущий момент ссылки отсутствуют.


(c) 2019 Дарья Олеговна Егорова, Анна Александровна Пьянкова

ISSN 1994-9952

Адрес учредителя и издателя:614990, г. Пермь, ул. Букирева, 15; ПГНИУ

Адрес редакции:614990, г. Пермь, ул. Букирева, 15; ПГНИУ, биофак

E-mail:  vestnik_psu_bio@mail.ru

Подписной индекс в каталоге ОАО «Пресса России. Том 1. Газеты и журналы»: 41000





Вестник Пермского университета. Биология=Bulletin of Perm University. Biology на elibrary