ЭФФЕКТЫ СЕМАФОРИНА 4D В ИММУННОЙ СИСТЕМЕ, ОПОСРЕДУЕМЫЕ ПЛЕКСИНОВЫМИ РЕЦЕПТОРАМИ
##plugins.themes.bootstrap3.article.main##
Аннотация
##plugins.themes.bootstrap3.article.details##
Лицензионный договор
на право использования научного произведения в научных журналах,
учредителем которых является Пермский государственный национальный исследовательский университет
г. Пермь " _____" _____________ 20____ г.
Федеральное государственное авономное образовательное учреждение высшего образования «Пермский государственный национальный исследовательский университет, именуемое в дальнейшем «Издатель» (Лицензиат), в лице проректора по научной работе и инновациям ПГНИУ Пьянкова Сергея Васильевича, действующего на основании доверенности от 11.05.2021 № 10-3/1585/2, с одной стороны, и
_____________________________________________________________________________________________ (ФИО полностью автора) _____________________________________________________________________________________________ (место работы автора)
E-mail: ___________________________SPIN-код (РИНЦ):_______________ AuthorID (РИНЦ):_______________ (автора)
ORCID: ______________________________________________________________________________________ (другие идентификаторы автора)
действующий(ие) от собственного имени, именуемый(е) в дальнейшем по отдельности или совместно «Автор» (Соавторы) (Лицензиар), заключили настоящий договор (далее «Договор») о публикации материалов в научных журналах Пермского государственного национального исследовательского университета на указанных ниже условиях.
- Автор с момента вступления настоящего Договора в силу предоставляет Издателю на безвозмездной основе исключительную лицензию на использование созданного Автором (Соавторами) научного произведения (далее «Статьи»), с названием: ______________________________________________________ ____________________________________________________________________________________________, одобренной и принятой к опубликованию Редколлегией научного журнала ПГНИУ в «Вестник Пермского университета. Серия Биология» в пределах, предусмотренных настоящим Договором, без сохранения за Автором (Соавторами) права выдачи аналогичных лицензий другим лицам.
В соответствии с п. 2 ст. 1270 ГК РФ и настоящим Договором под использованием Статьи понимается:
- воспроизведение Статьи или ее отдельной части в любой материальной форме, в том числе на бумажном и электронном носителе в журналах и/или базах данных Издателя и/или иных лиц, по усмотрению Издателя и/или Учредителя Журнала;
- распространение Статьи или ее отдельной части в составе Журнала и/или базах данных Издателя или иных лиц, по усмотрению Издателя и/или Учредителя Журнала, или в виде самостоятельного произведения по всему миру;
- доведение Статьи до всеобщего сведения таким образом, что любое лицо может получить доступ к Статье из любого места и в любое время по собственному выбору (доведение до всеобщего сведения, в т. ч. через Интернет);
- сублицензирование (выдача разрешения на использование Статьи и ее отдельных материалов) полученные по настоящему Договору права третьим лицам, с уведомлением Авторов об этом, путем размещения соответствующей информации на сайте Издателя;
- перевод с одного языка на другой или другая переработка произведения;
- иные права, прямо не переданные Издателю по настоящему Договору, включая патентные права на любые процессы, способы или методы и прочее, описанные Автором (Соавторами) в Статье, а также права на товарные знаки, сохраняются за Автором (Составителями), иными правообладателями.
Переводить Статью с языка оригинала на русский язык (в случае представления Автором статьи в журнал на иностранном языке) или с русского языка на английский, если редакция посчитает это целесообразным.
Предоставление прав по настоящему Договору включает право на обработку формы предоставления Статьи для ее использования во взаимодействии с компьютерными программами и системами (базами данных), публикации и распространения в машиночитаемом формате и внедрения в системы поиска (базы данных).
Публикация Статьи в Журнале осуществляется на условиях лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0).
- Автор (Соавторы) гарантирует, что:
2.1. Он(они) проинформировал(и) других Соавторов относительно условий этого Договора и получил(и) согласие всех Соавторов на заключение настоящего Договора на условиях, предусмотренных Договором.
2.2. Статья является оригинальным произведением, представленным на рассмотрение только этому Журналу, и что Автор (Соавторы) не публиковал(и) Статью ранее в объеме более 15% в других печатных и/или электронных изданиях, кроме публикации препринта (рукописи) Статьи.
2.3. Статья содержит все предусмотренные действующим законодательством об авторском праве ссылки на цитируемых авторов и/или издания (материалы), что Автором (Соавторами) получены все необходимые разрешения на используемые в Статье результаты, факты и иные заимствованные материалы, правообладателем которых Автор (Соавторы) не является(ются).
2.4. Статья не содержит материалы, не подлежащие опубликованию в открытой печати, в соответствии с действующими законодательными актами РФ и ее опубликование и распространение не приведет к разглашению секретной (конфиденциальной) информации (включая государственную тайну).
- Права и обязанности Автора (Соавторов)
3.1. Автор обязуется:
3.1.1. Соблюдать «Положение об этических стандартах редакционной политики Пермского государственного национального университета» и другие требования редакции журнала, опубликованные на сайте журнала.
3.1.2. Представить рукопись и метаданные Статьи в соответствии с Правилами для авторов, опубликованных на сайте Издателя или Журнала.
3.1.3. В процессе подготовки Статьи к опубликованию:
- вносить в текст и метаданные Статьи исправления, указанные рецензентами и принятые Редколлегией Журнала, и/или, при необходимости, по требованию Издателя доработать Статью;
- читать корректуру(ы) Статьи в сроки, предусмотренные графиком выхода Журнала;
- вносить в корректуру Статьи только тот минимум правки, который связан с необходимостью исправления допущенных в оригинале Статьи ошибок и/или внесения фактологических и конъюнктурных изменений.
3.1.4. Не публиковать Статью в объеме более 15% в других печатных и/или электронных изданиях на русском языке без согласия Издателя.
3.1.5. Не использовать в коммерческих целях и в других изданиях без согласия Издателя электронную копию Статьи, подготовленную Издателем, в случае его передачи Автору.
3.1.6. Получить (в дополнение к своей подписи) подпись Работодателя, если материалы Статьи были подготовлены в порядке выполнения служебного задания и являются собственностью Работодателя. Настоящим Договором Работодатель передает Издателю все права на использование Статьи на условиях, предусмотренных настоящим Договором.
3.1.7. В случае предъявления к Издателю требований, связанных с нарушением исключительных авторских и иных прав интеллектуальной собственности третьих лиц при создании Статьи, или в связи с заключением Автором (Соавторами) настоящего Договора, Автор обязуется:
- немедленно, после получения уведомления Издателя, принять меры к урегулированию споров с третьими лицами, при необходимости вступить в судебный процесс на стороне Издателя и предпринять все зависящие от него действия с целью исключения Издателя из числа ответчиков;
- возместить Издателю понесенные судебные расходы, расходы и убытки, вызванные применением мер обеспечения иска и исполнения судебного решения, и выплаченные третьему лицу суммы за нарушение исключительных авторских и иных прав интеллектуальной собственности, а также иные убытки, понесенные Издателем в связи с несоблюдением Автором (Соавторами) гарантий, предоставленных ими по настоящему Договору.
3.1.8. Отразить в личном профиле ORCID, указанном в настоящем договоре, факт публикации Статьи.
3.2. Автор (Соавторы) вправе:
3.2.1. Пользоваться печатными или электронным препринтом неизданной рукописи Статьи в форме и содержании, принятыми Издателем для публикации в Журнале. Такие препринты могут быть размещены в виде электронных файлов на веб-сайте Автора (Соавторов) или на защищенном внешнем веб-сайте работодателя Автора (Соавторов) Статьи, но не для коммерческих продаж или систематического внешнего распространения третьей стороной.
При этом Автор (Соавторы) должен(ы):
- включить в препринт следующее предупреждение: «Это препринт Статьи, принятой для публикации в (название Журнала, (©), авторское право (год). Владелец авторского права, указанный в Журнале)»;
- обеспечить электронную ссылку на сайт журнала или Издателя.
3.2.2. Право безвозмездно фотокопировать или передавать коллегам копию напечатанной Статьи целиком или частично для их личного или профессионального использования, для продвижения академических или научных исследований или для информационных целей работодателя.
3.2.3. Право использовать материалы из опубликованной Статьи в написанной Автором (Соавторами) книге.
3.2.4. Право использовать отдельные рисунки или таблицы и отрывки текста из Статьи в собственных целях обучения или для включения их в другую работу, или для представления в электронном формате во внутренней (защищенной) компьютерной сети или на внешнем веб-сайте Автора (Соавторов) или его работодателя.
3.2.5. Право включать материалы Статьи в учебные сборники для использования в аудитории, для безвозмездного распространения материалов лицам, обучающимся у Автора (Соавторов) или сохранять материалы в электронном формате на локальном сервере для доступа обучающимся как к части курса обучения, а также для внутренних обучающих программ в учреждении работодателя.
- Права и обязанности Издателя
Решение о принятии Статьи к опубликованию является исключительной прерогативой Лицензиата.
4.1. Издатель обязуется:
4.1.1. За свой счет обеспечить рецензирование Статьи, научное, литературное и художественно-техническое редактирование, изготовление и/или обработку иллюстративного материала, изготовление бумажного и электронного оригинал-макета. Воспроизведение в бумажной и электронной форме номера Журнала со статьей Автора и его распространение в соответствии с условиями настоящего Договора.
4.1.2.Довести результаты рецензирования до сведения Автора.
4.1.3. Согласовывать с Автором вносимую в Статью правку с учетом условий пп. 2. и 3.1 настоящего Договора.
4.1.4. Предоставить Автору после опубликования Статьи в Журнале электронный файл Статьи при условии предоставления Автором (Соавторами) электронных адресов.
- Издатель гарантирует:
- право на неприкосновенность Статьи и защиту от искажений, действующий стандарт полиграфических работ, защиту авторских прав от незаконного использования Статьи третьими лицами и соблюдение права авторства и права Автора (Соавторов) на имя.
- Издатель имеет право:
6.1. При любом последующем разрешенном использовании Автором (Соавторами) (и/или иными лицами) Журнала и/или Статьи (в том числе любой ее отдельной части, фрагмента), требовать от указанных лиц указания ссылки на Журнал, Издателя или иного правообладателя Журнала, Автора (Соавторов) или иных обладателей авторских прав, название Статьи, том, номер Журнала и год опубликования, указанных в(на) Журнале.
6.2. По своему усмотрению выплачивать по отдельным статьям, подготовленным по заказу Издателя (Редколлегии Журнала), но не являющимися итогом выполнения служебных обязанностей или служебного задания работодателя, авторский гонорар по расценкам, установленным Издателем.
6.3. Размещать в СМИ и других информационных источниках предварительную и/или рекламную информацию о предстоящей публикации Статьи.
6.4.Самостоятельно, без уведомления автора, снять статью с публикации или использовать иные способы отзыва (ретрагирования) статьи в случае обнаружения в части соблюдения этических норм при опубликовании статей.
6.5. Устанавливать правила (условия) приема и опубликования материалов Журнала. Редколлегии Журнала принадлежит исключительное право отбора и/или отклонения материалов, направляемых в редакцию Журнала с целью их опубликования. Рукопись (материальный носитель), направляемая Автором (Соавторами) в редакцию Журнала, возврату не подлежит. Редакция Журнала в переписку по вопросам отклонения Статьи Редколлегией Журнала не вступает.
- Другие условия Договора
7.1. Настоящий Договор вступает в силу в случае и с момента вынесения Редколлегией Журнала решения о принятии Статьи к опубликованию. Если Статья не принимается к публикации или Автор (Соавторы) на стадии принятия решения Редколлегией отозвал рукопись, настоящий Договор не вступает (утрачивает) в силу. Если Статья не принята к публикации, Издатель извещает об этом Автора в течение 15 календарных дней, при условии предоставления Автором (Соавторами) Редакции контактных телефонов (адресов).
7.2. В соответствии со ст. 1269 ГК РФ Автор (Соавторы) имеет право отказаться от ранее принятого решения об обнародовании (воспроизведении) Статьи (право на отзыв) при условии возмещения Издателю причиненных таким решением убытков. Если Статья опубликована, Автор (Соавторы) также обязан публично оповестить о ее отзыве. При этом Автор (Соавторы) вправе изъять из обращения ранее выпущенные экземпляры Статьи, Журнала, возместив причиненные этим убытки.
7.3. В целях обеспечения размещения журнала и данных о журнале на электронных ресурсах (электронные библиотеки и базы данных), и дальнейшего использования этих ресурсов пользователями, автор согласен на публикацию своих личных данных (фамилию, имя, отчество, адрес, должность, сведения о месте работы, ученую степень, ученое звание, адрес электронной почты, контактный(е) телефон(ы), цифровые идентификаторы и иные необходимые сведения – на русском и английском языках) на сайте научного журнала, на сайтах организаций (Пермский государственный национальный исследовательский университет, Научная электронная библиотека (НЭБ), Высшая аттестационная комиссия (ВАК), ООО «Издательство Лань», EBSCO, ООО «Агентство «Книга-Сервис», ООО «Итеос», ЗАО «Консультант Плюс», ООО «НПО «Гарант-Сервис-Университет» и другие).
В соответствии с требованиями статьи 9 Федерального закона от 27.07.2006 № 152-ФЗ «О персональных данных», автор дает свое согласие Пермскому государственному национальному исследовательскому университету на автоматизированную, а также без использования средств автоматизации, обработку своих персональных данных, включающих фамилию, имя, отчество, адрес, должность, сведения о месте работы, ученую степень, ученое звание, адрес электронной почты, контактный(е) телефон(ы), цифровые идентификаторы и иные необходимые сведения – на русском и английском языках, передачу (распространение) сторонним организациям в рамках деятельности научного журнала. Автор предоставляет Пермскому государственному национальному исследовательскому университету право осуществлять все действия (операции) со своими персональными данными, включая сбор, систематизацию, накопление, хранение, уточнение, обновление, изменение, использование, уничтожение, обезличивание, блокирование и передачу (распространение) сторонним организациям (Научная электронная библиотека (НЭБ), Высшая аттестационная комиссия (ВАК) и другие).
7.4. Стороны договорились, что в соответствии со ст. 160 ГК РФ, допускают и признают
воспроизведение текста настоящего Договора и подписей Сторон на настоящем Договоре и иных документах, связанных с его заключением, с помощью использования средств механического, электронного или иного копирования собственноручной подписи и текста Договора, которые будут иметь такую же силу, как подлинная подпись Стороны или оригинальный документ. Факсимильные (электронные) копии документов действительны и имеют равную юридическую силу наряду с подлинными.
7.5. В соответствии со ст. 428 ГК РФ настоящий Договор является договором присоединения (офертой), условия которого определяются Издателем, и может быть подписан другой стороной не иначе как путем присоединения к настоящему Договору в целом. Направление Автором (Соавторами) рукописи Статьи для опубликования в Журнале, считается акцептом, т. е. согласием Авторов (Соавторов) на опубликование Статьи в соответствии с условиями настоящего Договора.
7.6. К условиям настоящего Договора и правоотношениям Сторон, не урегулированных Договором, подлежит применение законодательства Российской Федерации.
7.7. Споры и разногласия, возникающие в связи с настоящим Договором, стороны стараются урегулировать путем переговоров.
7.8. В случае невозможности урегулирования споров и разногласий путем переговоров, они передаются на рассмотрение в Арбитражный суд по месту нахождения Лицензиата.
7.9. На основании статей 433 и 438 ГК РФ настоящий договор считается заключенным после наступления следующих событий:
- Получение Лицензиатом Статьи, предоставленной Автором в соответствии с п. 3.1 настоящего Договора;
- Подписания настоящего Договора обеими сторонами.
- Реквизиты и подписи сторон
|
Автор (Соавторы): |
Издатель: |
|
Ф. И.О.
Паспортные данные: ____________________________ Адрес: ________________________________________ Телефон: ______________________________________
e-mail: __________________________________________
Подпись: ________________________________________
|
федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Пермский государственный национальный исследовательский университет»
Юридический адрес: 614068, г. Пермь, ул. Букирева, 15 Адрес для корреспонденции: 614068, г. Пермь, ул. Букирева, 15
ИНН 5903003330 ОКТМО 57701000, ОКАТО 57401365000, ОГРН 1025900762150, ОКПО 02069071
Тел.: 8(342)239-61-12 Факс: 8 (342) 237-16-11 E-mail: _________________________________
Сайт: http://www.psu.ru/
Проректор по научной работе и инновациям ПГНИУ
__________________/ _____С.В. Пьянков_____ (Подпись) (Расшифровка подписи)
Согласовано Главный редактор научного журнала _________________________________ ____________________________________
__________________/ ______________________ (Подпись) (Расшифровка подписи) |
|
Автор (Соавторы): |
|
|
Ф. И.О.
Паспортные данные: ____________________________ Адрес: ________________________________________ Телефон: ______________________________________
e-mail: __________________________________________
Подпись: ________________________________________
|
Текст Договора размещен на сайте Пермского государственного национального исследовательского университета http://www.psu.ru/, а также его можно получить по электронной почте в «Отделе научных периодических и продолжающихся изданий ПГНИУ»: YakshnaN@psu.ru или в редакциях научных журналов ПГНИУ.
Библиографические ссылки
Artigiani S. et al. Functional regulation of semaphoring receptors by proprotein convertases // J. Biol. Chem. 2003.Vol. 278. P. 10094–10101.
Bougeret C. et al. Increased surface expression of a newly identified 150-kDa dimer early after human T lymphocyte activation // J. Immunol. 1992. Vol. 148. P. 318–323.
Chabbert-de Ponnat I. et al. Soluble CD100 functions on human monocytes and immature dendritic cells require plexin C1 and plexin B1, respectively // Int. Immunol. 2005. Vol. 17. P. 439–447.
Driessens M.H. et al. B plexins activate Rho through PDZ-RhoGEF // FEBS Lett. 2002. Vol. 529. P. 168–172.
Dubreuil C.I., Winton M.J., McKerracher L. Rho acti-vation patterns after spinal cord injury and the role of activated Rho in apoptosis in the central nervous system // J. Biol. Chem. 2003. Vol. 162. P. 233–243.
Fujisawa H. et al. Function of a cell adhesion mole-cule, plexin, in neuron network formation // Dev. Neurosci. 1997. Vol. 19, № 1. P. 101–105.
Gherardi E. et al. The sema domain // CurrOpin Struct. Biol. 2004. Vol. 14. P. 669–678.
Giraudon P. et al. Semaphorin CD100 from activated T lymphocytes induces process extension collapse in oligodendrocytes and death of immature neural cells // J. Immunol. 2004. Vol. 172. P. 1246–1255.
Granziero L. et al. CD100/Plexin-B1 interactions sus-tain proliferation and survival of normal and leu-kemic CD5þB lymphocytes // Blood. 2003. Vol. 101. P. 1962–1969.
Holl E.K. et al. Plexin-B2 and Plexin-D1 in dendritic cells: expression and IL-12/IL-23p40 production // PLoS One. 2012. Vol. 7, № 8. P. 1–9.
Ishida I. et al. Involvement of CD100, a lymphocyte semaphorin, in the activation of the human immune system via CD72: implications for the regulation of immune and inflammatory responses // International Immunology. 2003. Vol. 15. P. 1027–1034.
Jin Z., Strittmatter S.M. Rac1 mediates collapsin-1-induced growth cone collapse // J. Neurosci. 1997. Vol. 17. P. 6256–6263.
Kruger R.P., Aurandt J., Guan K.L. Semaphorins command cells to move // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2005. Vol. 6. P. 789–800.
Kuhn T.B. et al. Regulating actin dynamics in neuronal growth cones by ADF/cofilin and rho family GTPases // J. Neurobiol. 2000. Vol. 44. P. 126–144.
Lee J.Y. et al. 17β-Estradiol inhibits apoptotic cell death of oligodendrocytes by inhibiting RhoA-JNK3 activation after spinal cord injury // Endocri-nology. 2012. Vol. 153. P. 3815–3827.
Luque M.C. et al. CD100 and plexins B2 and B1 me-diate monocyteendothelial cell adhesion and might take part in atherogenesis // Mol. Immunol. 2015. Vol. 67. P. 559–567.
Nakamura F., Kalb R.G., Strittmatter S.M. Molecular basis of semaphorinmediated axon guidance // J. Neurobiol. 2000. Vol. 44. P. 219–229.
O’Connor B.P., Ting J.P. The evolving role of semaphorins and plexins in the immune system: Plexin-A1 regulation of dendritic cell function // Immunol. Res. 2008. Vol. 41. P. 217–222.
Ohta K. et al. Involvement of neuronal cell surface molecule B2 in the formation of retinal plexiform layers // Neuron. 1992. Vol. 9. P. 151–161.
Ohta K. et al. Plexin: a novel neuronal cell surface molecule that mediates cell adhesion via a homophilic binding mechanism in the presence of calcium ions // Neuron. 1995. Vol. 14. P. 1189–1199.
Oinuma I. et al. The Semaphorin 4D receptor Plexin-B1 is a GTPase activating protein for R-Ras // Science. 2004. Vol. 305. P. 862–865.
Okuno T. et al. Roles of Sema4D-plexin-B1 interactions in the central nervous system for pathogenesis of experimental autoimmune encephalomyelitis // J. Immunol. 2010. Vol. 184. P. 1499–1506.
Peral N., Sariola H., Immonen T. More than nervous: The emerging roles of plexins // Differentiation. 2012. Vol. 83. P. 77–91.
Rohm B. et al. Plexin/neuropilin complexes mediate repulsion by the axonal guidance signal semapho-rin 3A // Mech. Dev. 2000. Vol. 93. P. 95–104.
Roney K. et al. Plexin-B2 negatively regulates macro-phage motility, Rac, and Cdc42 activation // PLoS One. 2011. Vol. 6. P. 1–14.
Serini G. et al. Semaphorins and tumor angiogenesis // Angiogenesis. 2009. Vol. 12. P. 187–193.
Smith P. et al. Expression of neuroimmune semaphorins 4A and 4D and their receptors in the lung is enhanced by allergen and vascular endothelial growth factor // BMC Immunol. 2011. Vol. 19. P. 12–30.
Swiercz J.M. et al. Plexin-B1 directly interacts with PDZ-RhoGEF/LARG to regulate RhoA and growth cone morphology // Neuron. 2002. Vol. 35. P. 51–63.
Swiercz J.M., Worzfeld T., Offermanns S. ErbB-2 and met reciprocally regulate cellular signaling via plexin-B1 // J. Biol. Chem. 2008. Vol. 283. P. 1893–1901.
Таkahashi T. et al. Plexin-neuropilin-1 complexes form functional semaphorin-3A receptors // Cell. 1999. Vol. 99. P. 59–69.
Tamagnone L. et al. Plexins are a large family of receptors for transmembrane, secreted, and GPI-anchored semaphorins in vertebrates // Cell. 1999. Vol. 99. P. 71–80.
Tamagnone L., Comoglio P.M. Signalling by semaphorin receptors // Trends Cell Biol. 2000. Vol. 10. P. 377–383.
Toguchi M. et al. Involvement of Sema4D in the control of microglia activation // Neurochem. Int. 2009. Vol. 55. P. 573–580.
Toyofuku T. et al. FARP2 triggers signals for Sema3A-mediated axonal repulsion // Nat. Neurosci. 2005. Vol. 8. P. 1712–1719.
Walzer T., Galibert L., De Smedt T. Dendritic cell function in mice lacking Plexin C1 // Int. Immunol. 2005. Vol. 17. P. 943–950.
Yan H. et al. Plexin B2 and Semaphorin 4C Guide T Cell Recruitment and Function in the Germinal Center // Cell Rep. 2017. Vol. 19. P. 995–1007.
Yu D. et al. Axon growth and guidance genes identify T-dependent germinal centre B cells // Immunol. Cell. Biol. 2008. Vol. 86. P. 3–14.