ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ ТРЕХ ПОРОД ЛОШАДИ ДОМАШНЕЙ

Авторы

  • Юлиана/Juliana Удовна/Udovna Донт/Dohnt ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»
  • Анна/Anna Владимировна/Vladimirovna Тимарова/Timarova Филиал АО «НПО «Микроген» в г. Пермь «Пермское НПО «Биомед»
  • Лидия/Lidia Васильевна/Vasilevna Комарова/Komarova ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»
  • Светлана/Svetlana Витальевна/Vitalevna Боронникова/Boronnikova ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»

Ключевые слова:

ISSR-PCR маркеры, КГОlog, тракененская, рысистая и тяжеловозная породы, Equus сaballus L

Аннотация

Изучен генетический полиморфизм тракененской, рысистой и тяжеловозной пород лошади до-машней (Equus сaballus L., Equidae), как наиболее часто разводимых в Пермском крае. Для опре-деления генетического разнообразия пород E. сaballus был использован ISSR-метод анализа поли-морфизма ДНК. Выявлено 111 ISSR-PСR маркеров. Определены и проанализированы группы ге-нетических характеристик на уровне пород. Для характеристики генофондов пород E. сaballus ус-тановлены число молекулярных маркеров, доля полиморфных локусов, ожидаемая гетерозигот-ность, число редких аллелей. Генетическая специфика генофондов изученных пород выявлена с помощью коэффициента генетической оригинальности (КГОlog) и с учетом числа редких аллелей. Определены особи, в генотипе которых отмечены типичные и специфичные для генофонда аллели. Даны рекомендации по сохранению генофондов трех пород E. сaballus при разведении их в Пермском крае.

Биографии авторов

Юлиана/Juliana Удовна/Udovna Донт/Dohnt, ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»

Магистрант биологического факультета

Анна/Anna Владимировна/Vladimirovna Тимарова/Timarova, Филиал АО «НПО «Микроген» в г. Пермь «Пермское НПО «Биомед»

Микробиолог в отделе контроля качества

Лидия/Lidia Васильевна/Vasilevna Комарова/Komarova, ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»

Ассистент кафедры ботаники и генетики растений

Светлана/Svetlana Витальевна/Vitalevna Боронникова/Boronnikova, ФГБОУВО «Пермский государственный национальный исследовательский университет»

Доктор биологических наук, профессор, заведующийкафедрой ботаники и генетики растений

Библиографические ссылки

Боронникова С.В. Молекулярно-генетический анализ генофондов редких и исчезающих видов растений Пермского края: автореф. дис. … д-ра биол. наук. Уфа, 2009. 44 с.

Гавриличева И.С. и др. Идентификация и паспортизация генотипов лошадей по микросателлитам ДНК // Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и ветеринарии: сб. тез. докл.

-ой Всерос. молодеж. науч. конф. М., 2017. С. 24–27.

Глазко В.И. и др. ISSR-PCR маркеры и мобильные генетические элементы в геномах сельскохозяйственных видов млекопитающих // Сельскохозяйственная биология. 2013. № 2. С. 71–76.

Денискова Т.Е., Соловьева А.Д., Зиновьева Н.А. Изучение динамики изменений аллелофонда и генетического разнообразия в трех популяциях романовских овец с помощью микросателлитов

// Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и ветеринарии: сб. тез. докл. 17-ой Всерос. молодеж. науч. конф. М., 2017. С. 22–23.

Дубина Е.В., Мухина Ж.М. Молекулярные маркеры и их использование в селекционно-генетических исследованиях // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета. 2011. № 66. С. 1–11.

Календарь Р.Н., Боронникова С.В. Анализ молекулярно–генетического полиморфизма природных популяций редких видов растений Урала с помощью ретротранспозонов // Материалы четвертого Моск. междунар. конгресса «Биотехнология состояние и перспективы развития». М.,2007. Ч. 2. С. 121.

Лядова Н.С., Полковникова В.И. Эффективность использования лошадей разной типологии в досуговом коневодстве Пермского края // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2013. № 4(42). С. 128–132.

Нестерук Л.В., Макарова Н.Н., Свищева Г.Р., Столповский Ю.А. Оценка генетического разнообразия романовской породы овец с помощью коэффициента генетической оригинальности на основе данных ISSR-фингерпринтинга // Генетика. 2015. Т. 51, № 7. С. 847–852.

Нестерук Л.В. Генетический полиморфизм романовской породы овец: автореф. дис. … канд. биол. наук. М., 2016. 22 с.

Потокина Е.К., Александрова Т.Г. Методы классификации внутривидового разнообразия по результатам молекулярного маркирования // Фундаментальные и прикладные проблемы ботаники в начале XXI века: материалы Всерос. конф. Петрозаводск, 2008. Ч. 3. С. 62–65.

Храброва Л.А. Использование ДНК-технологий в коневодстве // Эффективное животноводство. 2015. № 6 (115). С.13-17.

Эркенов Т.А. Генетическая структура и внутрипородная дифференциация карачаевской лошади: автореф. дис. … канд. с/х. наук. М., 2015. 23 с.

Эрнст Л.К., Зиновьева Н.А. Биологические проблемы животноводства в XXI веке. М.: РАСХН, 2008. 501 с.

Erkenov T.A. et al. Generation of Molecular Genetic Markers in Studies of Genetic Structures of Horses // International Journal of Environmental Problems. 2017. Vol. 3, № 1. P. 36–46.

Glazko V.I. et al. Genetic Structure of Karachai Horses on ISSR-PCR Markers // Biogeosystem Technique, 2016. Vol. 9, № 3. P. 195–204.

Kimura M., Crow J.F. The number of alleles that can be maintained in a finite population // Genetics (US). 1964. Vol. 49. P. 725–738.

Nei M. Molecular Evolutionary Genetics. New York: Columbia University Press, 1987. 512 р.

Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Mol. Ecol. Not., 2006. Vol. 6. P. 288–295.

Yeh F.C., Young R.C., Mao J. POPGENE, the Microsoft Windows-based user-friendly software for population genetic analysis of co-dominant and dominant markers and quantitative traits // Department of Renewable Resources, Univ. of Alberta, Edmonton. Alta, 1999. 283 p.

Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. Genome fingerprinting by seguence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification // Genomics. 1994. Vol. 20. P. 176–183.

Williams J.G.K. et al. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers // Nucl. Acids Res. 1990. Vol. 18. P. 6531–6535.

References

Boronnikova S.V. Molekuljarno-genetičeskij analiz genofondov redkich i isčezajuščich vidov rastenij Permskogo kraja. Avtoref. diss. d-ra boil. Nauk [Molecular genetic analysis of genofond of rare and endangered plant species in Perm Krai: Abstract of. dis. doc. Biol. sciences]. Ufa, 2009. 44 p. (In Russ.).

Gavrilicheva I.S., Blokhina N.V., Khrabrova L.A., Tsareva M.A. [Identification and certification of horses genotypes by microsatellites of DNA]. Biotechnologija v rastenievodstve, životnovodstve i

veterinoriji [Biotechnology in crop production, animal husbandry and veterinary science: a collection of abstracts]. Moscow, 2017, pp. 24-27. (In Russ.).

Glazko V.I., Gladyr Е.А., Feofilov А.В. and et al. [ISSR-PCR Markers and mobile genetic elements in genomes of mammal agricultural species]. Sel’skochozjajstvennaja biologija, N 2 (2013): pp. 71-76. (In Russ.).

Deniskova T.E., Soloveva A.D., Zinoveva N.A. [The study of changes dynamics in allelofond and genetic diversity in three Romanov sheep population by microsatellites]. Biotechnologija v rastenievodstve,

životnovodstve i veterinoriji [Biotechnology in crop production, animal husbandry and veterinary science: a collection of abstracts]. Moscow, 2017, pp. 22-23. (In Russ.).

Dubina E.V., Muhina Yz. M. [Molecular markers and their use in breeding and genetic studies]. Politemetičeskij setevoj ělektronnyj naučnyj žurnal Kubanskogo gosudarstvennogo agrarnogo universiteta. N 66 (2011): pp. 1-11. (In Russ.).

Kalendar R.N., Boronnikova S.V. [Molecular genetic polymorphism analysis of natural populations of rare plant species in the Urals by retrotransposons]. Materialy četvertogo Moskovskogo meždunarodnogo kongressa [Materials of the Fourth Moscow. Intern. of the Congress “Expobiochem-technologies”]. Moscow, 2007, P. 2, p. 121. (In Russ.).

Lyadova N.S., Polkovnikova V.I. [Efficiency of different typology horses utilization in leisure horse breeding in Perm Krai]. Izvestija Orenburgskogo gosudarstvennogo agrarnogo universiteta N 4(42)

(2013): pp. 128-132. (In Russ.).

Nesteruk L.V. Genetičeskij polimorfizm romanovskoj porody ovec. Avtoref. diss. cand. boil. nauk [Genetic polymorphism of Romanov sheep: Abstract PhD dis.]. Moscow, 2016. 22 p. (In Russ).

Nesteruk L.V., Makarova N.N., Svishcheva G.R., Stolpovsky Yu.A. [Estimation of genetic diversity of Romanov sheep by the coefficient of genetic originality based on ISSR-fingerprinting data]. Genetika. V. 51, N 7 (2015): pp. 847-852. (In Russ.).

Potokina E.K., Aleksandrova T.G. [Methods of the intraspecific diversity classification as a result of molecular marking]. Fundamental’nye i prikladnye problemy botaniki v načale XXI veka [Fundamental

and Applied Botany at the Beginning of the 21st Century]. Petrozavodsk, 2008, pp. 62-65. (In Russ.).

Khrabrova L.A. [Using of DNA technologies in horse breeding]. Ěffektivnoe životnovodstvo. N 6 (115) (2015): pp. 13-17. (In Russ.).

Erkenov T.A. Genetičeskaja struktura i vnutriporolnaja differenciacija karačaevskoj lošadi. Avtoref. diss. cand. selchoz. nauk [Genetic structure and in-breed differentiation of the Karachai horse. Abstract of Cand. Diss.]. Mosсow, 2015. 23 p (In Russ.).

Ernst L.K., Zinoveva N.A. Biologičeskie problemy životnovodstva v XXI veke [Biological problems of livestock in the 21 century]. Moscow, 2008. 501 p. (In Russ.).

Erkenov T.A., Glazko V.I., Knyaseva E.F., Glazko T.T. Generation of Molecular Genetic Markers in Studies of Genetic Structures of Horses. International Journal of Environmental Problems, V. 3 (1) (2017): pp. 36-46.

Glazko V.I., Erkenov T.A., Glazko T.T., Dzatoev K.M. Genetic Structure of Karachai Horses on ISSR-PCR Markers. Biogeosystem Technique, V. 9(3) (2016): pp. 195-204.

Kimura M., Crow J.F. The number of alleles that can be maintained in a finite population. Genetics (US). V. 49 (1964): pp. 725-738.

Nei M. Molecular Evolutionary Genetics. New York, Columbia University Press, 1987. 512 р.

Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Mol. Ecol. Not. V. 6 (2006): pp. 288-295.

Yeh F.C., Young R.C., Mao J. POPGENE, the Microsoft Windows-based user-friendly software for population genetic analysis of co-dominant and dominant markers and quantitative traits. Edmonton, Department of Renewable Resources, Univ. of Alberta, 1999. 283 p.

Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. Genome fingerprinting by seguence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics. V. 20 (1994): pp. 176-183.

Williams J.G.K., Kubelik A.R., Livak K.J. et al. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucl. Acids Res. V. 18 (1990): pp. 6531-6535.

Загрузки

Опубликован

2018-11-10

Как цитировать

Донт/Dohnt Ю. У., Тимарова/Timarova А. В., Комарова/Komarova Л. В., & Боронникова/Boronnikova С. В. (2018). ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ ТРЕХ ПОРОД ЛОШАДИ ДОМАШНЕЙ. Вестник Пермского университета. Серия «Биология»=Bulletin of Perm University. Biology, (1), 50–56. извлечено от http://press.psu.ru/index.php/bio/article/view/1908

Наиболее читаемые статьи этого автора (авторов)